אור ירוק מסתורי הופך את כל האנושות לאבן. אלפי שנים אחר כך מתעורר סנקו אישיגמי, תלמיד מוכשר במיוחד במדעים, ואחריו חברו הגדול והחזק טאיג'ו. השניים מחליטים לבנות מחדש את הציוויליזציה מאפס ולהחיות עוד אנשים בדרך.
סנקו משתמש בידע המדעי שלו כדי לייצר כלים, תרופות וטכנולוגיה מחומרי הטבע. בין האנשים שהוא מעיר נמצאים יוזוריהה אוגאווה, צ'רום וג'ן אסאגירי, ומולו עומד טסוקאסה שישיו, הלוחם החזק ביותר, שמתחיל את דרכו כיריבו של סנקו.
Dr. Stone מבוססת על המנגה של ריצ'ירו אינאגאקי (תסריט) ובואיצ'י (איור). הסדרה הופקה באולפן TMS Entertainment בארבע עונות: Dr. Stone, Stone Wars, New World ו־Science Future, בסך הכול 94 פרקים בין יולי 2019 ליוני 2026. באוקטובר 2026 הוכרז המשך בשם Dr. Stone: Terraforming.